Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacs2Q3V3Q7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms