Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms