Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnga1P29974 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms