Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kif3aP28741 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms