Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb3P09026 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms