Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms