Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
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