Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoP15409 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoP15409 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoP15409 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoP15409 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoP15409 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoP15409 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoP15409 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoP15409 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoP15409 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoP15409 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoP15409 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoP15409 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoP15409 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoP15409 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoP15409 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoP15409 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoP15409 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoP15409 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoP15409 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoP15409 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoP15409 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoP15409 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoP15409 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoP15409 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoP15409 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoP15409 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoP15409 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoP15409 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoP15409 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhoP15409 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhoP15409 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhoP15409 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhoP15409 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RhoP15409 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhoP15409 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RhoP15409 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhoP15409 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhoP15409 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhoP15409 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhoP15409 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhoP15409 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhoP15409 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhoP15409 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhoP15409 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhoP15409 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhoP15409 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhoP15409 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhoP15409 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoP15409 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoP15409 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoP15409 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoP15409 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoP15409 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoP15409 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoP15409 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoP15409 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoP15409 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoP15409 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoP15409 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoP15409 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoP15409 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoP15409 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoP15409 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoP15409 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoP15409 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoP15409 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoP15409 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoP15409 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoP15409 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoP15409 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoP15409 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoP15409 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoP15409 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhoP15409 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhoP15409 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhoP15409 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RhoP15409 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhoP15409 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhoP15409 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RhoP15409 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhoP15409 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhoP15409 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RhoP15409 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhoP15409 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhoP15409 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhoP15409 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RhoP15409 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RhoP15409 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhoP15409 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhoP15409 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhoP15409 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhoP15409 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhoP15409 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhoP15409 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhoP15409 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhoP15409 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhoP15409 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhoP15409 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhoP15409 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms