Protein–RNA interactions for Protein: P09405

Ncl, Nucleolin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclP09405 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NclP09405 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NclP09405 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NclP09405 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NclP09405 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NclP09405 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NclP09405 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NclP09405 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NclP09405 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NclP09405 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NclP09405 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NclP09405 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NclP09405 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NclP09405 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NclP09405 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NclP09405 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NclP09405 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NclP09405 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NclP09405 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NclP09405 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NclP09405 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NclP09405 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NclP09405 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NclP09405 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NclP09405 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NclP09405 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NclP09405 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NclP09405 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NclP09405 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NclP09405 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NclP09405 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NclP09405 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NclP09405 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NclP09405 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NclP09405 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NclP09405 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NclP09405 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NclP09405 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NclP09405 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NclP09405 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NclP09405 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NclP09405 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NclP09405 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NclP09405 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NclP09405 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NclP09405 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NclP09405 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NclP09405 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NclP09405 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
NclP09405 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NclP09405 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NclP09405 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NclP09405 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NclP09405 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NclP09405 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NclP09405 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NclP09405 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NclP09405 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NclP09405 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NclP09405 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NclP09405 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NclP09405 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NclP09405 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NclP09405 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NclP09405 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NclP09405 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NclP09405 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NclP09405 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NclP09405 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NclP09405 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NclP09405 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NclP09405 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NclP09405 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NclP09405 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NclP09405 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NclP09405 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NclP09405 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NclP09405 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NclP09405 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NclP09405 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NclP09405 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NclP09405 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NclP09405 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NclP09405 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NclP09405 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NclP09405 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NclP09405 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NclP09405 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NclP09405 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NclP09405 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NclP09405 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NclP09405 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NclP09405 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NclP09405 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NclP09405 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NclP09405 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NclP09405 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NclP09405 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NclP09405 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NclP09405 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms