Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb3P09026 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms