Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.5 ms