Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc8Q9CYA6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc8Q9CYA6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc8Q9CYA6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc8Q9CYA6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc8Q9CYA6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc8Q9CYA6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc8Q9CYA6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc8Q9CYA6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc8Q9CYA6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc8Q9CYA6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc8Q9CYA6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc8Q9CYA6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc8Q9CYA6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc8Q9CYA6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc8Q9CYA6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc8Q9CYA6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc8Q9CYA6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc8Q9CYA6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc8Q9CYA6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc8Q9CYA6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc8Q9CYA6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc8Q9CYA6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc8Q9CYA6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc8Q9CYA6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc8Q9CYA6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc8Q9CYA6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc8Q9CYA6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc8Q9CYA6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc8Q9CYA6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc8Q9CYA6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc8Q9CYA6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc8Q9CYA6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc8Q9CYA6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc8Q9CYA6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc8Q9CYA6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc8Q9CYA6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc8Q9CYA6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc8Q9CYA6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms