Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl27Q99N92 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms