Protein–RNA interactions for Protein: Q8K467

Tmie, Transmembrane inner ear expressed protein, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmieQ8K467 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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TmieQ8K467 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TmieQ8K467 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TmieQ8K467 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TmieQ8K467 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TmieQ8K467 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TmieQ8K467 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TmieQ8K467 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TmieQ8K467 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TmieQ8K467 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
TmieQ8K467 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TmieQ8K467 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TmieQ8K467 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TmieQ8K467 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TmieQ8K467 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TmieQ8K467 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TmieQ8K467 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TmieQ8K467 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TmieQ8K467 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TmieQ8K467 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TmieQ8K467 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TmieQ8K467 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TmieQ8K467 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TmieQ8K467 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TmieQ8K467 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TmieQ8K467 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TmieQ8K467 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TmieQ8K467 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TmieQ8K467 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms