Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psme1P97371 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psme1P97371 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psme1P97371 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Psme1P97371 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psme1P97371 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Psme1P97371 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psme1P97371 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psme1P97371 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms