Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms