Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna3O08545 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna3O08545 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna3O08545 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna3O08545 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna3O08545 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna3O08545 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna3O08545 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna3O08545 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms