Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PnckQ9QYK9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PnckQ9QYK9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PnckQ9QYK9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1274.1 ms