Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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NipblQ6KCD5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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NipblQ6KCD5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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