Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142 ms