Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI2

Slc44a5, Choline transporter-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a5Q5RJI2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc44a5Q5RJI2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms