Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 428.5 ms