Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Kif3aP28741 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms