Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb3P09026 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113 ms