Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bbip1J3QMK2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bbip1J3QMK2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Bbip1J3QMK2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bbip1J3QMK2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bbip1J3QMK2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bbip1J3QMK2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bbip1J3QMK2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bbip1J3QMK2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bbip1J3QMK2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bbip1J3QMK2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bbip1J3QMK2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bbip1J3QMK2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bbip1J3QMK2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bbip1J3QMK2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bbip1J3QMK2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bbip1J3QMK2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bbip1J3QMK2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bbip1J3QMK2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bbip1J3QMK2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bbip1J3QMK2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Bbip1J3QMK2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bbip1J3QMK2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bbip1J3QMK2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bbip1J3QMK2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bbip1J3QMK2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bbip1J3QMK2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bbip1J3QMK2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bbip1J3QMK2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bbip1J3QMK2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bbip1J3QMK2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bbip1J3QMK2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bbip1J3QMK2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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