Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER39

Tor1a, Torsin-1A, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tor1aQ9ER39 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tor1aQ9ER39 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms