Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.1 ms