Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.7 ms