Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms