Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI2

Slc44a5, Choline transporter-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a5Q5RJI2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc44a5Q5RJI2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms