Protein–RNA interactions for Protein: P23506

Pcmt1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmt1P23506 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcmt1P23506 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcmt1P23506 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms