Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prf1P10820 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prf1P10820 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prf1P10820 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prf1P10820 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Prf1P10820 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prf1P10820 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms