Protein–RNA interactions for Protein: P09405

Ncl, Nucleolin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclP09405 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NclP09405 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NclP09405 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NclP09405 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NclP09405 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NclP09405 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NclP09405 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NclP09405 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NclP09405 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NclP09405 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NclP09405 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NclP09405 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NclP09405 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NclP09405 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NclP09405 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NclP09405 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NclP09405 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NclP09405 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NclP09405 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NclP09405 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NclP09405 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NclP09405 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NclP09405 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NclP09405 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NclP09405 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NclP09405 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NclP09405 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NclP09405 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NclP09405 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NclP09405 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NclP09405 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NclP09405 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NclP09405 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NclP09405 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NclP09405 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NclP09405 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NclP09405 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NclP09405 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NclP09405 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NclP09405 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NclP09405 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NclP09405 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NclP09405 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NclP09405 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NclP09405 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NclP09405 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NclP09405 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NclP09405 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NclP09405 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NclP09405 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NclP09405 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NclP09405 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NclP09405 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NclP09405 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NclP09405 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NclP09405 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NclP09405 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NclP09405 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NclP09405 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NclP09405 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NclP09405 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NclP09405 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NclP09405 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NclP09405 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NclP09405 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NclP09405 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NclP09405 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NclP09405 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NclP09405 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NclP09405 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NclP09405 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NclP09405 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NclP09405 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NclP09405 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NclP09405 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NclP09405 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NclP09405 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NclP09405 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NclP09405 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NclP09405 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NclP09405 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NclP09405 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NclP09405 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NclP09405 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NclP09405 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NclP09405 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NclP09405 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NclP09405 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NclP09405 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NclP09405 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NclP09405 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NclP09405 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NclP09405 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NclP09405 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NclP09405 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NclP09405 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NclP09405 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NclP09405 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NclP09405 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NclP09405 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms