Protein–RNA interactions for Protein: P01666

Ig kappa chain V-III region PC 7183, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01666 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01666 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01666 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01666 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01666 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01666 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01666 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01666 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01666 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01666 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01666 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01666 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01666 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01666 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01666 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01666 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01666 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01666 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01666 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01666 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01666 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01666 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01666 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01666 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01666 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01666 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01666 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01666 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01666 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01666 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01666 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01666 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01666 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01666 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01666 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01666 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01666 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01666 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01666 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01666 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01666 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01666 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01666 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01666 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01666 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01666 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01666 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01666 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01666 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01666 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01666 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01666 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01666 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01666 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01666 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01666 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01666 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01666 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01666 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01666 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01666 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01666 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01666 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01666 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01666 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01666 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01666 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01666 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01666 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01666 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01666 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01666 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01666 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01666 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01666 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01666 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01666 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01666 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01666 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01666 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01666 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01666 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01666 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01666 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01666 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01666 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01666 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01666 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01666 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01666 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01666 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01666 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01666 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01666 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01666 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01666 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01666 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01666 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01666 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01666 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms