Protein–RNA interactions for Protein: B1AXP3

Saxo1, MCG1697, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saxo1B1AXP3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Saxo1B1AXP3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.9 ms