Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms