Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms