Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PnckQ9QYK9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PnckQ9QYK9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PnckQ9QYK9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PnckQ9QYK9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PnckQ9QYK9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PnckQ9QYK9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PnckQ9QYK9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PnckQ9QYK9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PnckQ9QYK9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PnckQ9QYK9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PnckQ9QYK9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PnckQ9QYK9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PnckQ9QYK9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PnckQ9QYK9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PnckQ9QYK9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PnckQ9QYK9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PnckQ9QYK9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PnckQ9QYK9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PnckQ9QYK9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PnckQ9QYK9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PnckQ9QYK9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PnckQ9QYK9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PnckQ9QYK9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PnckQ9QYK9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PnckQ9QYK9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PnckQ9QYK9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PnckQ9QYK9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PnckQ9QYK9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PnckQ9QYK9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PnckQ9QYK9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PnckQ9QYK9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PnckQ9QYK9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PnckQ9QYK9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PnckQ9QYK9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PnckQ9QYK9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PnckQ9QYK9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PnckQ9QYK9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PnckQ9QYK9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms