Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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