Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms