Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MitfQ08874 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MitfQ08874 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MitfQ08874 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MitfQ08874 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MitfQ08874 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MitfQ08874 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MitfQ08874 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MitfQ08874 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MitfQ08874 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MitfQ08874 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms