Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 188.4 ms