Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pfdn6Q03958 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms