Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms