Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoP15409 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoP15409 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoP15409 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoP15409 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoP15409 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoP15409 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoP15409 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoP15409 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoP15409 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoP15409 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoP15409 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoP15409 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoP15409 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoP15409 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoP15409 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoP15409 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoP15409 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoP15409 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoP15409 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoP15409 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoP15409 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoP15409 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoP15409 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoP15409 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoP15409 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoP15409 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoP15409 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoP15409 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoP15409 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoP15409 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoP15409 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoP15409 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoP15409 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoP15409 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhoP15409 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoP15409 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoP15409 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoP15409 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoP15409 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoP15409 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoP15409 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoP15409 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoP15409 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoP15409 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoP15409 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoP15409 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoP15409 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoP15409 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoP15409 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoP15409 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoP15409 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoP15409 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoP15409 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoP15409 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoP15409 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoP15409 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoP15409 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoP15409 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoP15409 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoP15409 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoP15409 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoP15409 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoP15409 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoP15409 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoP15409 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoP15409 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoP15409 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoP15409 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoP15409 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoP15409 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoP15409 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoP15409 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoP15409 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoP15409 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoP15409 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoP15409 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoP15409 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoP15409 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoP15409 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoP15409 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoP15409 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoP15409 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoP15409 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoP15409 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoP15409 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoP15409 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoP15409 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoP15409 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoP15409 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoP15409 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RhoP15409 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
RhoP15409 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RhoP15409 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoP15409 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoP15409 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoP15409 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoP15409 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoP15409 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoP15409 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms