Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms