Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms