Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bbip1J3QMK2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms