Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer4aF8VPX6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms