Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms